Hab mir fast gedacht, daß es IDE-Laufwerke waren. Die sind aber recht unproblematisch, weil sie die Windows- Standardtreiber nutzen. Die meisten Fehler kommen eigentlich durch schlampig programmierte Treiber von Drittanbietern.

Andererseits, wenn es im abgesicherten Modus geht, hört es sich schon nach Treiberproblem an.

Die Windows Dienste sind auch sehr heikel, normal werden die aber durch Software eigentlich nicht geändert.

TuneUp ist da aber schon ganz oK., hat auch eine Registry-Bereinigungsfunktion. Empfehlen könnt ich dir noch CCleaner (Freeware).
Bei den anderen Tools, die es da noch so gibt, wäre ich sehr vorsichtig, die entfernen manchmal zu viel und wenn du kein Backup hast gibts viel Arbeit.

Evtl. hast du doch irgendwo ein Wackelkontakt (Spannungsschwankungen) oder Kabelbruch?
Letzte Möglichkeit: andere Software an Stelle von Audiograbber.
Das gefällt dir aber sicher weniger.